FunTax: työkalu sienten DNA-tunnistukseen

Application summary

Sienet ovat tärkeä osa Suomen luontoa ja sen monimuotoisuutta. Sienilajien luotettava tunnistaminen, tutkiminen ja kartoittaminen on ensiarvoisen tärkeää, jotta pystyisimme paremmin ymmärtämään ja suojelemaan Suomen luontoa. Sienten tunnistuksessa, tutkimuksessa ja seurannassa käytetään nykyään enenevässä määrin DNA-viivakoodeja, koska niiden avulla sienilajistoa voidaan tunnistaa huomattavasti kattavammin ja luotettavammin kuin perinteisen itiöemien morfologisen määrityksen avulla. Ongelmana on kuitenkin saadun sekvenssiaineiston määrittäminen. Tällä hetkellä määritys täytyy tehdä käyttäen kansainvälisiä sekvenssitietokantoja, joissa nimien käyttö on sekavaa eikä monesti vastaa nimistön käyttöä Suomessa. Tällöin tulosten tulkitseminen on erittäin aikaa vievää ja siihen tarvitaan aina sieniasiantuntijan apua. DNA-viivakooditietokantojen kehittäminen onkin nostettu yhdeksi tärkeimmistä kehityskohteista ympäristö-DNA:n laajamittaiseksi käyttöönottamiseksi sienilajiston tutkimukseen ja seurantaan Suomessa. Hankkeemme tavoitteena on tehdä kaikille avoin Suomen helttasienten ja tattien sekvenssitunnistuspalvelu FunTax, jonka avulla käyttäjä saa selkeät lajinimet sekvenssiaineistolleen. Etuna nykyiseen tilanteeseen on, että tietokannan käyttäjän ei tarvitse itse olla lajiasiantuntija. Lisäksi nimistö on täysin yhteneväinen Suomen lajilistan kanssa ja käyttäjä saa samalla tiedon lajien uhanalaisuusluokituksesta sekä linkin laji.fi palveluun koottuun tietoon lajista kuten levinneisyyteen ja ekologiaan. FunTax-palvelu myös ilmoittaa käyttäjälle, mikäli laji on mahdollisesti Suomelle tai tieteelle aiemmin tuntematon. FunTax-palvelu yhdistettynä e-DNA:n käyttöön tulee lyhyessä ajassa moninkertaistamaan meidän havainnointimme ja tietomme Suomen sienilajistosta. Tämän hankkeen myötä Suomen on mahdollista olla edelläkävijä ja suunnannäyttäjä maana, jonka sienilajistoa pystytään luotettavasti ja yksiselitteisesti tunnistamaan.